Dalam studi terkini yang diterbitkan di Nature Communications , para peneliti menyelidiki fungsi mikrobioma usus dalam penuaan menggunakan sekuens metagenomik shotgun mendalam dari warga Singapura yang berusia lanjut.
Latar belakang
Meningkatnya prevalensi gangguan kronis terkait penuaan di Asia disebabkan oleh pergeseran demografi yang cepat. Tidak adanya data in vivo berkualitas tinggi membuat sulit untuk memahami peran rumit variabel mikroba usus dalam penuaan yang sehat. Ada kebutuhan untuk menemukan terapi gaya hidup, nutrisi, dan farmakologis untuk penuaan yang sehat di antara budaya Asia.
Penelitian telah menemukan hubungan antara mikrobiota usus dan usia, dengan berbagai lintasan yang berkaitan dengan jenis kelamin dan usia. Indeks penuaan sehat dan kerapuhan dikaitkan dengan status mikrobiota usus, dan keragaman komposisi dapat menjadi biomarker untuk penuaan sehat. Ukuran kelompok dan rentang usia menghambat upaya untuk menentukan mikrobioma usus pada individu yang lebih tua menggunakan metagenomik shotgun .
Tentang penelitian ini
Dalam studi saat ini, para peneliti mempelajari perubahan mikrobioma usus tingkat spesies sebagai fungsi usia pada masyarakat berusia delapan puluhan yang tinggal di komunitas Singapura.
Kumpulan data studi meliputi SG90 (234 individu berusia 77 hingga 97 tahun), SPMP (109 individu berusia 53 hingga 74 tahun), studi diabetes tipe 2 (171 individu berusia 21 hingga 70 tahun), dan CPE (82 individu berusia 21 hingga 80 tahun). Peserta memberikan sampel darah untuk menilai kadar glukosa darah puasa, trigliserida, lipoprotein densitas rendah (LDL), lipoprotein densitas tinggi (HDL), kolesterol total, protein C-reaktif sensitivitas tinggi (hs-CRP), aspartat aminotransferase (AST), alanin transaminase (ALT), dan Vitamin B 12 .
Sampel tinja mereka menjalani pengurutan metagenomik secara acak untuk mengungkap profil taksonomi tingkat spesies beresolusi tinggi. Para peneliti mengoreksi profil ini untuk efek kelompok menggunakan kelompok usia sebagai kovariat. Mereka mengekstraksi asam deoksiribonukleat (DNA) dari sampel tinja untuk reaksi berantai polimerase (PCR) pengayaan.
Para peneliti melakukan analisis tingkat spesies gabungan dan mengukur ekspresi gen serta kelimpahan jalur. Analisis jalur metabolik menunjukkan empat jalur utama untuk produksi butirat. Tim juga melakukan analisis keragaman fungsional dan mikroba. Mereka mengaitkan mikrobiota usus dengan penanda utama untuk kesehatan kardiometabolik, kesehatan hati, dan peradangan untuk mengidentifikasi fungsi mikroba usus tambahan yang terkait dengan penuaan yang sehat.
