Virus influenza burung A(H5N1), yang menyebar ke ternak dan menginfeksi 14 orang tahun ini, dideteksi menggunakan pengurutan virome dalam air limbah 10 kota Texas. Virus flu burung A(H5N1), yang menyebar ke ternak dan menginfeksi 14 orang tahun ini, dideteksi menggunakan pengurutan virome dalam air limbah di 10 kota Texas oleh para peneliti di UTHealth Houston dan Baylor College of Medicine. Virom adalah kumpulan virus dalam sampel, dalam hal ini sampel air limbah.
Namun dari 4 Maret hingga 15 Juli (akhir pengumpulan data untuk artikel ini), H5N1 terdeteksi di 10 dari 10 kota, 22 dari 23 lokasi, dan 100 dari 399 sampel.
Namun, banyaknya H5N1 dalam sampel air limbah yang dikumpulkan dari waktu ke waktu tidak berkorelasi dengan rawat inap terkait influenza selama periode waktu yang sama, sehingga risikonya bagi masyarakat sangat rendah.
UTHealth Houston dan Baylor menetapkan program pengujian air limbah sebagai bagian dari Texas Epidemic Public Health Institute (TEPHI).
Protokol pengurutan yang digunakan oleh tim tersebut dapat mendeteksi perubahan genetik yang mungkin mengindikasikan adaptasi virus pada mamalia, bahkan mungkin manusia.
Kurangnya beban klinis pada manusia dan informasi genom menunjukkan bahwa sumber beban virus yang ditemukan dalam air limbah selama rentang waktu tersebut berasal dari hewan.
Namun, para peneliti menyimpulkan, pengawasan berkelanjutan sangat penting untuk memantau setiap adaptasi evolusi yang menunjukkan potensi penularan ke manusia.
Penulis utama surat jurnal tersebut adalah Michael J. Tisza, PhD, asisten profesor virologi molekuler dan mikrobiologi di Baylor; Blake Hanson, PhD, asisten profesor di Pusat Penyakit Menular di Sekolah Kesehatan Masyarakat UTHealth Houston; Eric Boerwinkle, PhD, direktur TEPHI dan dekan, Kozmetsky Family Chair dalam Genetika Manusia, dan M. David Low Chair dalam Kesehatan Masyarakat di Sekolah Kesehatan Masyarakat; dan Anthony W. Maresso, PhD, Joseph L. Melnick Chair of Virology di Baylor.
Boerwinkle dan Hanson juga merupakan anggota Pusat Kanker MD Anderson Universitas Texas, Sekolah Pascasarjana Ilmu Biomedis UTHealth Houston.
Tim mendeteksi virus dalam air limbah dengan menggunakan perangkat penangkap probe virus yang menargetkan ribuan spesies atau varian virus.
Sejak Mei 2022, TEPHI telah mendeteksi lebih dari 400 virus manusia dan hewan, beberapa di antaranya (SARS-CoV-2, influenza, dan mpox) telah berkorelasi dengan data kasus klinis dalam populasi.
Penulis surat dari UTHealth Houston termasuk Kristina Mena, PhD, Jane Dale Owen Chair dalam Perlindungan Kesehatan Lingkungan; Anna Gitter, PhD; Fuqing Wu, PhD; Janelle Rios, MPH, PhD; dan Jennifer Deegan, MPAff. Dari Baylor College of Medicine: Justin Clark, PhD; Li Wang, MD, PhD; Katelyn Payne, BS, Matthew Ross, PhD; Sara Javornik Cregeen, PhD; Juwan Cormier, PhD; Vasanthi Avadhanula, PhD; Austen Terwilliger, PhD; Pedro Piedra, MD; Joseph Petrosino, PhD. John Balliew, dari El Paso Water Utility, juga merupakan penulis surat.
